Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYKP43405 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYKP43405 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYKP43405 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYKP43405 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYKP43405 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYKP43405 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYKP43405 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYKP43405 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYKP43405 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYKP43405 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYKP43405 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYKP43405 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYKP43405 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYKP43405 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYKP43405 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYKP43405 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYKP43405 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYKP43405 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYKP43405 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYKP43405 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYKP43405 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SYKP43405 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYKP43405 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYKP43405 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYKP43405 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYKP43405 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYKP43405 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYKP43405 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYKP43405 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYKP43405 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYKP43405 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYKP43405 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYKP43405 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYKP43405 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYKP43405 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYKP43405 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYKP43405 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYKP43405 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYKP43405 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYKP43405 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYKP43405 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYKP43405 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYKP43405 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYKP43405 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYKP43405 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYKP43405 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYKP43405 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYKP43405 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SYKP43405 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYKP43405 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYKP43405 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYKP43405 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYKP43405 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYKP43405 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYKP43405 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYKP43405 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYKP43405 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYKP43405 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYKP43405 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYKP43405 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYKP43405 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYKP43405 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYKP43405 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYKP43405 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYKP43405 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYKP43405 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYKP43405 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYKP43405 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYKP43405 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SYKP43405 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYKP43405 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYKP43405 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYKP43405 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYKP43405 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYKP43405 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYKP43405 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYKP43405 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYKP43405 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYKP43405 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYKP43405 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYKP43405 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SYKP43405 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYKP43405 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYKP43405 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYKP43405 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYKP43405 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYKP43405 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYKP43405 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYKP43405 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYKP43405 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYKP43405 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYKP43405 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYKP43405 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYKP43405 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYKP43405 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYKP43405 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYKP43405 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYKP43405 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYKP43405 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms