Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HTTP42858 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HTTP42858 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HTTP42858 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HTTP42858 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HTTP42858 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HTTP42858 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HTTP42858 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HTTP42858 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HTTP42858 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HTTP42858 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HTTP42858 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HTTP42858 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HTTP42858 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HTTP42858 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HTTP42858 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HTTP42858 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HTTP42858 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HTTP42858 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HTTP42858 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
HTTP42858 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HTTP42858 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HTTP42858 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HTTP42858 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HTTP42858 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HTTP42858 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HTTP42858 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HTTP42858 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
HTTP42858 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
HTTP42858 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HTTP42858 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HTTP42858 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29■■■□□ 2.23
HTTP42858 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HTTP42858 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HTTP42858 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HTTP42858 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HTTP42858 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HTTP42858 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
HTTP42858 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HTTP42858 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HTTP42858 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HTTP42858 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HTTP42858 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HTTP42858 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HTTP42858 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HTTP42858 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HTTP42858 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HTTP42858 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HTTP42858 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HTTP42858 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HTTP42858 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
HTTP42858 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HTTP42858 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HTTP42858 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HTTP42858 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HTTP42858 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HTTP42858 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HTTP42858 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HTTP42858 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HTTP42858 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HTTP42858 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HTTP42858 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HTTP42858 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HTTP42858 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HTTP42858 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HTTP42858 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HTTP42858 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HTTP42858 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HTTP42858 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HTTP42858 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HTTP42858 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HTTP42858 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HTTP42858 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HTTP42858 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HTTP42858 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
HTTP42858 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HTTP42858 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HTTP42858 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HTTP42858 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HTTP42858 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HTTP42858 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HTTP42858 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HTTP42858 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HTTP42858 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HTTP42858 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HTTP42858 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HTTP42858 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HTTP42858 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HTTP42858 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HTTP42858 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HTTP42858 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HTTP42858 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HTTP42858 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HTTP42858 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
HTTP42858 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
HTTP42858 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HTTP42858 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HTTP42858 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HTTP42858 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HTTP42858 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms