Protein–RNA interactions for Protein: P42771

CDKN2A, Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AP42771 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKN2AP42771 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKN2AP42771 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN2AP42771 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms