Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP3P42574 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP3P42574 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP3P42574 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP3P42574 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP3P42574 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP3P42574 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP3P42574 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP3P42574 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP3P42574 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP3P42574 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP3P42574 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP3P42574 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP3P42574 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP3P42574 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP3P42574 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP3P42574 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP3P42574 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP3P42574 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP3P42574 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP3P42574 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP3P42574 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP3P42574 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP3P42574 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP3P42574 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP3P42574 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP3P42574 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP3P42574 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP3P42574 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP3P42574 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP3P42574 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP3P42574 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP3P42574 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP3P42574 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP3P42574 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP3P42574 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP3P42574 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP3P42574 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP3P42574 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP3P42574 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP3P42574 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP3P42574 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP3P42574 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP3P42574 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP3P42574 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP3P42574 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP3P42574 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP3P42574 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP3P42574 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP3P42574 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP3P42574 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP3P42574 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP3P42574 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP3P42574 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP3P42574 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP3P42574 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP3P42574 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP3P42574 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP3P42574 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP3P42574 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP3P42574 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP3P42574 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP3P42574 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP3P42574 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP3P42574 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP3P42574 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP3P42574 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP3P42574 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP3P42574 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP3P42574 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP3P42574 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP3P42574 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP3P42574 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP3P42574 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP3P42574 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP3P42574 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP3P42574 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP3P42574 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP3P42574 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP3P42574 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP3P42574 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP3P42574 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP3P42574 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP3P42574 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP3P42574 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP3P42574 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP3P42574 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP3P42574 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP3P42574 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP3P42574 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP3P42574 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP3P42574 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP3P42574 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP3P42574 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP3P42574 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP3P42574 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP3P42574 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP3P42574 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP3P42574 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP3P42574 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms