Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIA2P42262 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIA2P42262 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIA2P42262 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIA2P42262 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIA2P42262 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIA2P42262 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIA2P42262 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIA2P42262 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIA2P42262 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIA2P42262 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIA2P42262 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIA2P42262 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIA2P42262 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIA2P42262 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIA2P42262 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIA2P42262 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIA2P42262 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIA2P42262 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIA2P42262 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIA2P42262 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIA2P42262 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA2P42262 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA2P42262 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA2P42262 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA2P42262 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA2P42262 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIA2P42262 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIA2P42262 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIA2P42262 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIA2P42262 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIA2P42262 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIA2P42262 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIA2P42262 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIA2P42262 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIA2P42262 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIA2P42262 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRIA2P42262 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms