Protein–RNA interactions for Protein: P41271

NBL1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBL1P41271 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBL1P41271 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBL1P41271 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBL1P41271 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBL1P41271 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NBL1P41271 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBL1P41271 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBL1P41271 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBL1P41271 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBL1P41271 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBL1P41271 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NBL1P41271 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NBL1P41271 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBL1P41271 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBL1P41271 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBL1P41271 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBL1P41271 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBL1P41271 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBL1P41271 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBL1P41271 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBL1P41271 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBL1P41271 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBL1P41271 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBL1P41271 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBL1P41271 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBL1P41271 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBL1P41271 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBL1P41271 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NBL1P41271 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBL1P41271 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBL1P41271 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBL1P41271 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBL1P41271 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBL1P41271 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBL1P41271 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBL1P41271 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NBL1P41271 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBL1P41271 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBL1P41271 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBL1P41271 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBL1P41271 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NBL1P41271 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBL1P41271 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBL1P41271 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBL1P41271 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBL1P41271 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBL1P41271 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBL1P41271 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBL1P41271 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBL1P41271 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBL1P41271 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBL1P41271 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NBL1P41271 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBL1P41271 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBL1P41271 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBL1P41271 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBL1P41271 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NBL1P41271 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBL1P41271 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBL1P41271 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBL1P41271 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NBL1P41271 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBL1P41271 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NBL1P41271 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBL1P41271 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NBL1P41271 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBL1P41271 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBL1P41271 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBL1P41271 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBL1P41271 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NBL1P41271 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBL1P41271 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBL1P41271 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBL1P41271 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBL1P41271 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NBL1P41271 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBL1P41271 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBL1P41271 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBL1P41271 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBL1P41271 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBL1P41271 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBL1P41271 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBL1P41271 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBL1P41271 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBL1P41271 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBL1P41271 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBL1P41271 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBL1P41271 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBL1P41271 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NBL1P41271 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBL1P41271 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBL1P41271 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBL1P41271 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NBL1P41271 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBL1P41271 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBL1P41271 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NBL1P41271 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBL1P41271 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBL1P41271 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBL1P41271 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms