Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HSPA9P38646 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HSPA9P38646 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HSPA9P38646 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HSPA9P38646 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HSPA9P38646 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HSPA9P38646 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HSPA9P38646 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HSPA9P38646 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
HSPA9P38646 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSPA9P38646 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSPA9P38646 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms