Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ITGAEP38570 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ITGAEP38570 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ITGAEP38570 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
ITGAEP38570 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ITGAEP38570 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ITGAEP38570 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ITGAEP38570 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ITGAEP38570 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ITGAEP38570 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ITGAEP38570 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ITGAEP38570 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ITGAEP38570 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ITGAEP38570 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ITGAEP38570 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ITGAEP38570 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
ITGAEP38570 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.73
ITGAEP38570 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ITGAEP38570 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ITGAEP38570 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ITGAEP38570 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ITGAEP38570 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ITGAEP38570 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
ITGAEP38570 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ITGAEP38570 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ITGAEP38570 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
ITGAEP38570 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ITGAEP38570 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ITGAEP38570 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ITGAEP38570 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ITGAEP38570 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ITGAEP38570 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ITGAEP38570 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ITGAEP38570 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ITGAEP38570 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
ITGAEP38570 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ITGAEP38570 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ITGAEP38570 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ITGAEP38570 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ITGAEP38570 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ITGAEP38570 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
ITGAEP38570 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ITGAEP38570 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ITGAEP38570 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ITGAEP38570 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ITGAEP38570 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
ITGAEP38570 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ITGAEP38570 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ITGAEP38570 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ITGAEP38570 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ITGAEP38570 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ITGAEP38570 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
ITGAEP38570 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ITGAEP38570 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ITGAEP38570 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ITGAEP38570 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ITGAEP38570 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ITGAEP38570 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ITGAEP38570 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ITGAEP38570 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ITGAEP38570 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ITGAEP38570 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ITGAEP38570 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ITGAEP38570 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ITGAEP38570 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ITGAEP38570 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ITGAEP38570 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ITGAEP38570 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
ITGAEP38570 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ITGAEP38570 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ITGAEP38570 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
ITGAEP38570 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ITGAEP38570 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
ITGAEP38570 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ITGAEP38570 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
ITGAEP38570 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ITGAEP38570 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ITGAEP38570 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ITGAEP38570 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ITGAEP38570 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
ITGAEP38570 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ITGAEP38570 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ITGAEP38570 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ITGAEP38570 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ITGAEP38570 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ITGAEP38570 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ITGAEP38570 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ITGAEP38570 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.05■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ITGAEP38570 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms