Protein–RNA interactions for Protein: P36100

TFA1, Transcription initiation factor IIE subunit alpha, yeastyeast

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFA1P36100 SUI2YJR007W 915 nt12.4□□□□□ -0.42
TFA1P36100 NAT4YMR069W 858 nt12.4□□□□□ -0.42
TFA1P36100 GEP7YGL057C 864 nt12.39□□□□□ -0.43
TFA1P36100 MSF1YPR047W 1410 nt12.38□□□□□ -0.43
TFA1P36100 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt12.38□□□□□ -0.43
TFA1P36100 RTT103YDR289C 1230 nt12.38□□□□□ -0.43
TFA1P36100 PSR1YLL010C 1284 nt12.38□□□□□ -0.43
TFA1P36100 ERG24YNL280C 1317 nt12.37□□□□□ -0.43
TFA1P36100 PML1YLR016C 615 nt12.37□□□□□ -0.43
TFA1P36100 HSL7YBR133C 2484 nt12.37□□□□□ -0.43
TFA1P36100 VHS1YDR247W 1386 nt12.36□□□□□ -0.43
TFA1P36100 NSE3YDR288W 912 nt12.36□□□□□ -0.43
TFA1P36100 SEC65YML105C 822 nt12.36□□□□□ -0.43
TFA1P36100 EFM2YBR271W 1260 nt12.36□□□□□ -0.43
TFA1P36100 YLR173WYLR173W 1827 nt12.35□□□□□ -0.43
TFA1P36100 YFL052WYFL052W 1398 nt12.35□□□□□ -0.43
TFA1P36100 AIM23YJL131C 1071 nt12.35□□□□□ -0.43
TFA1P36100 DPH5YLR172C 903 nt12.35□□□□□ -0.43
TFA1P36100 YSA1YBR111C 696 nt12.35□□□□□ -0.43
TFA1P36100 YJR124CYJR124C 1347 nt12.35□□□□□ -0.43
TFA1P36100 BUD26YDR241W 288 nt12.34□□□□□ -0.43
TFA1P36100 PPE1YHR075C 1203 nt12.34□□□□□ -0.43
TFA1P36100 YMR007WYMR007W 381 nt12.34□□□□□ -0.43
TFA1P36100 MCT1YOR221C 1083 nt12.34□□□□□ -0.43
TFA1P36100 RPN8YOR261C 1017 nt12.33□□□□□ -0.44
TFA1P36100 ABD1YBR236C 1311 nt12.33□□□□□ -0.44
TFA1P36100 BIM1YER016W 1035 nt12.32□□□□□ -0.44
TFA1P36100 ARD1YHR013C 717 nt12.32□□□□□ -0.44
TFA1P36100 SPO16YHR153C 597 nt12.32□□□□□ -0.44
TFA1P36100 YOL035CYOL035C 303 nt12.32□□□□□ -0.44
TFA1P36100 ATG29YPL166W 642 nt12.32□□□□□ -0.44
TFA1P36100 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt12.32□□□□□ -0.44
TFA1P36100 RGT2YDL138W 2292 nt12.31□□□□□ -0.44
TFA1P36100 YNL247WYNL247W 2304 nt12.31□□□□□ -0.44
TFA1P36100 PCL2YDL127W 927 nt12.31□□□□□ -0.44
TFA1P36100 SFA1YDL168W 1161 nt12.31□□□□□ -0.44
TFA1P36100 SKI8YGL213C 1194 nt12.31□□□□□ -0.44
TFA1P36100 RIM8YGL045W 1629 nt12.3□□□□□ -0.44
TFA1P36100 UBC5YDR059C 447 nt12.3□□□□□ -0.44
TFA1P36100 YGR168CYGR168C 1131 nt12.3□□□□□ -0.44
TFA1P36100 POM34YLR018C 900 nt12.3□□□□□ -0.44
TFA1P36100 SPO20YMR017W 1194 nt12.3□□□□□ -0.44
TFA1P36100 RDL1YOR285W 420 nt12.3□□□□□ -0.44
TFA1P36100 ADE16YLR028C 1776 nt12.3□□□□□ -0.44
TFA1P36100 PRP9YDL030W 1593 nt12.3□□□□□ -0.44
TFA1P36100 CMR1YDL156W 1569 nt12.3□□□□□ -0.44
TFA1P36100 PIB1YDR313C 861 nt12.29□□□□□ -0.44
TFA1P36100 YFR020WYFR020W 699 nt12.29□□□□□ -0.44
TFA1P36100 SHH4YLR164W 507 nt12.29□□□□□ -0.44
TFA1P36100 YML089CYML089C 369 nt12.29□□□□□ -0.44
TFA1P36100 YOL162WYOL162W 648 nt12.29□□□□□ -0.44
TFA1P36100 TIF5YPR041W 1218 nt12.29□□□□□ -0.44
TFA1P36100 CKS1YBR135W 453 nt12.29□□□□□ -0.44
TFA1P36100 YBR292CYBR292C 372 nt12.29□□□□□ -0.44
TFA1P36100 UTR1YJR049C 1593 nt12.29□□□□□ -0.44
TFA1P36100 YPK3YBR028C 1578 nt12.29□□□□□ -0.44
TFA1P36100 SRM1YGL097W 1449 nt12.28□□□□□ -0.44
TFA1P36100 ADE17YMR120C 1779 nt12.28□□□□□ -0.44
TFA1P36100 YCR087WYCR087W 516 nt12.28□□□□□ -0.44
TFA1P36100 RMD1YDL001W 1293 nt12.28□□□□□ -0.44
TFA1P36100 ARO3YDR035W 1113 nt12.28□□□□□ -0.44
TFA1P36100 YGL218WYGL218W 651 nt12.28□□□□□ -0.44
TFA1P36100 SAM35YHR083W 990 nt12.28□□□□□ -0.44
TFA1P36100 ARG3YJL088W 1017 nt12.28□□□□□ -0.44
TFA1P36100 YMR209CYMR209C 1374 nt12.28□□□□□ -0.44
TFA1P36100 YDR541CYDR541C 1035 nt12.27□□□□□ -0.45
TFA1P36100 UFD1YGR048W 1086 nt12.27□□□□□ -0.45
TFA1P36100 YSR3YKR053C 1215 nt12.26□□□□□ -0.45
TFA1P36100 YMR178WYMR178W 825 nt12.26□□□□□ -0.45
TFA1P36100 ATP4YPL078C 735 nt12.26□□□□□ -0.45
TFA1P36100 PTM1YKL039W 1572 nt12.26□□□□□ -0.45
TFA1P36100 GAP1YKR039W 1809 nt12.25□□□□□ -0.45
TFA1P36100 YML094C-AYML094C-A 402 nt12.25□□□□□ -0.45
TFA1P36100 ZRT3YKL175W 1512 nt12.25□□□□□ -0.45
TFA1P36100 YEL023CYEL023C 2049 nt12.25□□□□□ -0.45
TFA1P36100 YCR025CYCR025C 411 nt12.24□□□□□ -0.45
TFA1P36100 HSP31YDR533C 714 nt12.24□□□□□ -0.45
TFA1P36100 SCP1YOR367W 603 nt12.24□□□□□ -0.45
TFA1P36100 PHO89YBR296C 1725 nt12.24□□□□□ -0.45
TFA1P36100 YKR015CYKR015C 1707 nt12.23□□□□□ -0.45
TFA1P36100 KRE28YDR532C 1158 nt12.23□□□□□ -0.45
TFA1P36100 YHR112CYHR112C 1137 nt12.23□□□□□ -0.45
TFA1P36100 DAL2YIR029W 1032 nt12.23□□□□□ -0.45
TFA1P36100 CTK2YJL006C 972 nt12.23□□□□□ -0.45
TFA1P36100 YJR096WYJR096W 849 nt12.23□□□□□ -0.45
TFA1P36100 THI80YOR143C 960 nt12.23□□□□□ -0.45
TFA1P36100 YPR084WYPR084W 1371 nt12.22□□□□□ -0.45
TFA1P36100 HEL2YDR266C 1920 nt12.22□□□□□ -0.45
TFA1P36100 YGL034CYGL034C 366 nt12.22□□□□□ -0.45
TFA1P36100 CTR2YHR175W 570 nt12.22□□□□□ -0.45
TFA1P36100 MND2YIR025W 1107 nt12.22□□□□□ -0.45
TFA1P36100 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt12.22□□□□□ -0.45
TFA1P36100 MRPL4YLR439W 960 nt12.22□□□□□ -0.45
TFA1P36100 YAP7YOL028C 738 nt12.22□□□□□ -0.45
TFA1P36100 PFA5YDR459C 1125 nt12.21□□□□□ -0.45
TFA1P36100 COG7YGL005C 840 nt12.21□□□□□ -0.45
TFA1P36100 HAM1YJR069C 594 nt12.21□□□□□ -0.45
TFA1P36100 VPS20YMR077C 666 nt12.21□□□□□ -0.45
TFA1P36100 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt12.21□□□□□ -0.45
TFA1P36100 MAM3YOL060C 2121 nt12.21□□□□□ -0.45
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