Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER4P35408 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER4P35408 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGER4P35408 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGER4P35408 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGER4P35408 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGER4P35408 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGER4P35408 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGER4P35408 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER4P35408 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER4P35408 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGER4P35408 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER4P35408 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGER4P35408 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER4P35408 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER4P35408 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGER4P35408 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGER4P35408 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTGER4P35408 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGER4P35408 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGER4P35408 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER4P35408 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms