Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFTPDP35247 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SFTPDP35247 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFTPDP35247 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFTPDP35247 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SFTPDP35247 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFTPDP35247 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SFTPDP35247 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFTPDP35247 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFTPDP35247 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFTPDP35247 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFTPDP35247 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFTPDP35247 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFTPDP35247 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFTPDP35247 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFTPDP35247 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFTPDP35247 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFTPDP35247 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFTPDP35247 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFTPDP35247 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFTPDP35247 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPDP35247 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms