Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA3P32297 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA3P32297 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA3P32297 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA3P32297 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA3P32297 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA3P32297 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA3P32297 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA3P32297 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA3P32297 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA3P32297 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA3P32297 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA3P32297 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA3P32297 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA3P32297 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA3P32297 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA3P32297 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA3P32297 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNA3P32297 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNA3P32297 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNA3P32297 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNA3P32297 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA3P32297 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms