Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
L1CAMP32004 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
L1CAMP32004 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
L1CAMP32004 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms