Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC25CP30307 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC25CP30307 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC25CP30307 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC25CP30307 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC25CP30307 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC25CP30307 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC25CP30307 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC25CP30307 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC25CP30307 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC25CP30307 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC25CP30307 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC25CP30307 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC25CP30307 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC25CP30307 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC25CP30307 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC25CP30307 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC25CP30307 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC25CP30307 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC25CP30307 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC25CP30307 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC25CP30307 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC25CP30307 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC25CP30307 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC25CP30307 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC25CP30307 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC25CP30307 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC25CP30307 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC25CP30307 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC25CP30307 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC25CP30307 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC25CP30307 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CDC25CP30307 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC25CP30307 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC25CP30307 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC25CP30307 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC25CP30307 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC25CP30307 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC25CP30307 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC25CP30307 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC25CP30307 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC25CP30307 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC25CP30307 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CDC25CP30307 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC25CP30307 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC25CP30307 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC25CP30307 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC25CP30307 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC25CP30307 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC25CP30307 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC25CP30307 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC25CP30307 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC25CP30307 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC25CP30307 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC25CP30307 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms