Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP5DP30049 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP5DP30049 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP5DP30049 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATP5DP30049 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms