Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJB2P29033 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJB2P29033 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJB2P29033 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJB2P29033 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJB2P29033 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJB2P29033 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJB2P29033 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJB2P29033 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJB2P29033 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJB2P29033 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJB2P29033 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJB2P29033 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJB2P29033 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJB2P29033 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJB2P29033 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJB2P29033 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJB2P29033 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJB2P29033 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJB2P29033 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJB2P29033 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJB2P29033 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJB2P29033 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJB2P29033 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJB2P29033 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJB2P29033 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJB2P29033 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJB2P29033 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJB2P29033 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJB2P29033 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJB2P29033 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJB2P29033 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJB2P29033 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJB2P29033 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJB2P29033 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJB2P29033 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GJB2P29033 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJB2P29033 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJB2P29033 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJB2P29033 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJB2P29033 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJB2P29033 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJB2P29033 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJB2P29033 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJB2P29033 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJB2P29033 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJB2P29033 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJB2P29033 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJB2P29033 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJB2P29033 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJB2P29033 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJB2P29033 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJB2P29033 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJB2P29033 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJB2P29033 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJB2P29033 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJB2P29033 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJB2P29033 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJB2P29033 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJB2P29033 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJB2P29033 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJB2P29033 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJB2P29033 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GJB2P29033 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJB2P29033 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJB2P29033 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJB2P29033 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB2P29033 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB2P29033 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJB2P29033 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GJB2P29033 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GJB2P29033 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GJB2P29033 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJB2P29033 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GJB2P29033 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJB2P29033 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJB2P29033 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJB2P29033 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJB2P29033 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJB2P29033 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJB2P29033 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJB2P29033 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJB2P29033 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJB2P29033 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJB2P29033 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJB2P29033 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJB2P29033 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJB2P29033 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJB2P29033 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJB2P29033 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJB2P29033 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJB2P29033 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJB2P29033 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GJB2P29033 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJB2P29033 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GJB2P29033 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJB2P29033 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJB2P29033 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJB2P29033 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJB2P29033 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms