Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTX3P26022 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTX3P26022 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTX3P26022 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTX3P26022 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTX3P26022 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTX3P26022 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTX3P26022 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTX3P26022 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTX3P26022 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTX3P26022 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTX3P26022 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTX3P26022 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTX3P26022 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTX3P26022 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTX3P26022 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTX3P26022 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTX3P26022 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTX3P26022 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTX3P26022 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTX3P26022 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTX3P26022 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTX3P26022 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTX3P26022 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTX3P26022 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTX3P26022 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTX3P26022 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTX3P26022 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTX3P26022 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTX3P26022 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTX3P26022 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTX3P26022 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTX3P26022 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTX3P26022 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTX3P26022 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTX3P26022 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTX3P26022 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTX3P26022 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTX3P26022 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTX3P26022 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTX3P26022 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTX3P26022 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTX3P26022 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTX3P26022 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTX3P26022 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTX3P26022 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTX3P26022 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTX3P26022 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTX3P26022 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTX3P26022 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTX3P26022 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTX3P26022 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTX3P26022 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTX3P26022 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTX3P26022 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTX3P26022 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTX3P26022 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTX3P26022 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTX3P26022 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTX3P26022 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTX3P26022 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTX3P26022 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTX3P26022 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTX3P26022 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTX3P26022 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTX3P26022 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTX3P26022 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTX3P26022 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTX3P26022 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTX3P26022 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTX3P26022 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTX3P26022 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTX3P26022 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTX3P26022 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTX3P26022 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTX3P26022 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTX3P26022 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTX3P26022 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTX3P26022 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTX3P26022 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTX3P26022 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTX3P26022 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTX3P26022 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTX3P26022 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTX3P26022 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTX3P26022 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTX3P26022 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTX3P26022 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTX3P26022 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTX3P26022 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTX3P26022 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTX3P26022 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTX3P26022 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTX3P26022 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTX3P26022 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTX3P26022 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTX3P26022 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTX3P26022 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTX3P26022 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTX3P26022 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms