Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKCHP24723 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCHP24723 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRKCHP24723 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
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