Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP11P24347 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP11P24347 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP11P24347 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP11P24347 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP11P24347 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP11P24347 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP11P24347 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP11P24347 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP11P24347 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP11P24347 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP11P24347 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP11P24347 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP11P24347 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP11P24347 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP11P24347 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP11P24347 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP11P24347 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP11P24347 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP11P24347 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP11P24347 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP11P24347 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP11P24347 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP11P24347 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP11P24347 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP11P24347 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP11P24347 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP11P24347 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP11P24347 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP11P24347 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP11P24347 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP11P24347 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP11P24347 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP11P24347 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP11P24347 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP11P24347 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP11P24347 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP11P24347 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP11P24347 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP11P24347 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP11P24347 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP11P24347 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP11P24347 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP11P24347 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP11P24347 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP11P24347 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP11P24347 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP11P24347 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP11P24347 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MMP11P24347 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MMP11P24347 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MMP11P24347 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MMP11P24347 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP11P24347 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP11P24347 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP11P24347 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP11P24347 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP11P24347 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP11P24347 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP11P24347 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP11P24347 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP11P24347 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP11P24347 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP11P24347 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP11P24347 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP11P24347 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP11P24347 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP11P24347 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP11P24347 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP11P24347 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP11P24347 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP11P24347 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP11P24347 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP11P24347 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP11P24347 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP11P24347 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP11P24347 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP11P24347 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP11P24347 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP11P24347 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP11P24347 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP11P24347 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP11P24347 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP11P24347 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP11P24347 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP11P24347 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP11P24347 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP11P24347 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP11P24347 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP11P24347 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP11P24347 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP11P24347 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP11P24347 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP11P24347 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP11P24347 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP11P24347 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP11P24347 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP11P24347 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP11P24347 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP11P24347 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms