Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RPS6KB1P23443 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RPS6KB1P23443 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPS6KB1P23443 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPS6KB1P23443 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPS6KB1P23443 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPS6KB1P23443 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPS6KB1P23443 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPS6KB1P23443 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPS6KB1P23443 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPS6KB1P23443 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPS6KB1P23443 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPS6KB1P23443 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPS6KB1P23443 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPS6KB1P23443 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RPS6KB1P23443 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RPS6KB1P23443 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPS6KB1P23443 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms