Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHCGRP22888 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHCGRP22888 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHCGRP22888 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHCGRP22888 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHCGRP22888 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHCGRP22888 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHCGRP22888 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHCGRP22888 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHCGRP22888 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LHCGRP22888 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHCGRP22888 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHCGRP22888 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LHCGRP22888 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LHCGRP22888 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms