Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGFR3P22607 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGFR3P22607 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGFR3P22607 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGFR3P22607 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGFR3P22607 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
FGFR3P22607 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGFR3P22607 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGFR3P22607 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGFR3P22607 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGFR3P22607 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGFR3P22607 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGFR3P22607 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGFR3P22607 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGFR3P22607 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGFR3P22607 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGFR3P22607 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGFR3P22607 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGFR3P22607 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FGFR3P22607 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGFR3P22607 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGFR3P22607 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGFR3P22607 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGFR3P22607 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGFR3P22607 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGFR3P22607 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGFR3P22607 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms