Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBPP18428 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBPP18428 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBPP18428 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBPP18428 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBPP18428 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBPP18428 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBPP18428 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBPP18428 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBPP18428 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LBPP18428 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LBPP18428 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LBPP18428 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LBPP18428 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LBPP18428 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LBPP18428 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LBPP18428 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LBPP18428 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LBPP18428 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LBPP18428 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LBPP18428 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LBPP18428 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LBPP18428 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LBPP18428 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LBPP18428 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LBPP18428 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LBPP18428 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LBPP18428 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LBPP18428 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LBPP18428 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LBPP18428 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LBPP18428 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LBPP18428 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LBPP18428 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LBPP18428 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LBPP18428 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LBPP18428 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LBPP18428 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LBPP18428 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LBPP18428 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LBPP18428 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LBPP18428 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LBPP18428 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LBPP18428 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LBPP18428 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LBPP18428 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LBPP18428 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LBPP18428 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LBPP18428 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LBPP18428 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LBPP18428 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LBPP18428 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LBPP18428 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LBPP18428 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LBPP18428 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LBPP18428 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LBPP18428 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LBPP18428 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LBPP18428 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LBPP18428 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBPP18428 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBPP18428 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBPP18428 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBPP18428 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBPP18428 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LBPP18428 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBPP18428 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBPP18428 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBPP18428 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBPP18428 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LBPP18428 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LBPP18428 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LBPP18428 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LBPP18428 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LBPP18428 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LBPP18428 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LBPP18428 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LBPP18428 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LBPP18428 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LBPP18428 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LBPP18428 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LBPP18428 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LBPP18428 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LBPP18428 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LBPP18428 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LBPP18428 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LBPP18428 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LBPP18428 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LBPP18428 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LBPP18428 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LBPP18428 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LBPP18428 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LBPP18428 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LBPP18428 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LBPP18428 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LBPP18428 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LBPP18428 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LBPP18428 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LBPP18428 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LBPP18428 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms