Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STMN1P16949 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STMN1P16949 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STMN1P16949 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STMN1P16949 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STMN1P16949 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STMN1P16949 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STMN1P16949 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STMN1P16949 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
STMN1P16949 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
STMN1P16949 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STMN1P16949 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25■■□□□ 1.59
STMN1P16949 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STMN1P16949 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
STMN1P16949 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STMN1P16949 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STMN1P16949 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STMN1P16949 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STMN1P16949 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STMN1P16949 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STMN1P16949 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STMN1P16949 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STMN1P16949 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STMN1P16949 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STMN1P16949 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STMN1P16949 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STMN1P16949 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STMN1P16949 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STMN1P16949 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STMN1P16949 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STMN1P16949 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STMN1P16949 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STMN1P16949 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STMN1P16949 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STMN1P16949 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STMN1P16949 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STMN1P16949 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STMN1P16949 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STMN1P16949 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STMN1P16949 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STMN1P16949 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STMN1P16949 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STMN1P16949 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STMN1P16949 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STMN1P16949 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STMN1P16949 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STMN1P16949 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STMN1P16949 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STMN1P16949 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STMN1P16949 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STMN1P16949 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STMN1P16949 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STMN1P16949 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STMN1P16949 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STMN1P16949 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STMN1P16949 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STMN1P16949 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STMN1P16949 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STMN1P16949 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STMN1P16949 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STMN1P16949 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STMN1P16949 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STMN1P16949 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STMN1P16949 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STMN1P16949 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STMN1P16949 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STMN1P16949 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STMN1P16949 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STMN1P16949 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STMN1P16949 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STMN1P16949 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STMN1P16949 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STMN1P16949 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STMN1P16949 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STMN1P16949 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STMN1P16949 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
STMN1P16949 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STMN1P16949 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
STMN1P16949 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STMN1P16949 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STMN1P16949 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STMN1P16949 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STMN1P16949 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STMN1P16949 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STMN1P16949 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STMN1P16949 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STMN1P16949 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STMN1P16949 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STMN1P16949 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STMN1P16949 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STMN1P16949 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STMN1P16949 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STMN1P16949 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STMN1P16949 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STMN1P16949 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
STMN1P16949 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STMN1P16949 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STMN1P16949 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STMN1P16949 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STMN1P16949 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms