Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTLA4P16410 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTLA4P16410 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTLA4P16410 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTLA4P16410 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms