Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HLA-EP13747 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-EP13747 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-EP13747 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-EP13747 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-EP13747 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms