Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT13P13646 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT13P13646 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT13P13646 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT13P13646 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT13P13646 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT13P13646 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT13P13646 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT13P13646 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT13P13646 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT13P13646 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT13P13646 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT13P13646 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT13P13646 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT13P13646 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT13P13646 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT13P13646 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT13P13646 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT13P13646 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT13P13646 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT13P13646 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT13P13646 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT13P13646 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT13P13646 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT13P13646 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT13P13646 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT13P13646 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT13P13646 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT13P13646 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT13P13646 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT13P13646 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT13P13646 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT13P13646 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT13P13646 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT13P13646 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT13P13646 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT13P13646 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT13P13646 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT13P13646 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT13P13646 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT13P13646 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT13P13646 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT13P13646 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT13P13646 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT13P13646 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT13P13646 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT13P13646 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT13P13646 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT13P13646 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT13P13646 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT13P13646 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT13P13646 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT13P13646 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT13P13646 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT13P13646 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT13P13646 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT13P13646 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT13P13646 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT13P13646 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT13P13646 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT13P13646 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT13P13646 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT13P13646 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT13P13646 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT13P13646 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT13P13646 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT13P13646 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT13P13646 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT13P13646 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT13P13646 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT13P13646 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT13P13646 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT13P13646 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT13P13646 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT13P13646 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT13P13646 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT13P13646 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT13P13646 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT13P13646 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT13P13646 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT13P13646 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT13P13646 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT13P13646 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
KRT13P13646 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT13P13646 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT13P13646 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT13P13646 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT13P13646 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT13P13646 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT13P13646 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT13P13646 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT13P13646 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT13P13646 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT13P13646 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT13P13646 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT13P13646 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT13P13646 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT13P13646 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT13P13646 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT13P13646 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms