Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP1A3P13637 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP1A3P13637 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP1A3P13637 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP1A3P13637 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP1A3P13637 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP1A3P13637 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP1A3P13637 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP1A3P13637 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP1A3P13637 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP1A3P13637 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP1A3P13637 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP1A3P13637 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP1A3P13637 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP1A3P13637 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP1A3P13637 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP1A3P13637 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP1A3P13637 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP1A3P13637 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP1A3P13637 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP1A3P13637 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP1A3P13637 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP1A3P13637 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP1A3P13637 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP1A3P13637 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP1A3P13637 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP1A3P13637 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP1A3P13637 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP1A3P13637 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP1A3P13637 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP1A3P13637 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP1A3P13637 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP1A3P13637 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP1A3P13637 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP1A3P13637 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP1A3P13637 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP1A3P13637 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP1A3P13637 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP1A3P13637 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP1A3P13637 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP1A3P13637 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP1A3P13637 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP1A3P13637 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP1A3P13637 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP1A3P13637 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP1A3P13637 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP1A3P13637 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP1A3P13637 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP1A3P13637 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP1A3P13637 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP1A3P13637 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP1A3P13637 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP1A3P13637 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP1A3P13637 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP1A3P13637 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP1A3P13637 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP1A3P13637 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP1A3P13637 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP1A3P13637 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP1A3P13637 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP1A3P13637 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATP1A3P13637 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP1A3P13637 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP1A3P13637 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP1A3P13637 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP1A3P13637 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP1A3P13637 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP1A3P13637 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP1A3P13637 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP1A3P13637 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP1A3P13637 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP1A3P13637 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP1A3P13637 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP1A3P13637 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms