Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RARGP13631 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RARGP13631 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RARGP13631 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARGP13631 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARGP13631 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARGP13631 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARGP13631 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RARGP13631 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARGP13631 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RARGP13631 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RARGP13631 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RARGP13631 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RARGP13631 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RARGP13631 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RARGP13631 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RARGP13631 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RARGP13631 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RARGP13631 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RARGP13631 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RARGP13631 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RARGP13631 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RARGP13631 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RARGP13631 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RARGP13631 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RARGP13631 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RARGP13631 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RARGP13631 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RARGP13631 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RARGP13631 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RARGP13631 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RARGP13631 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RARGP13631 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RARGP13631 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RARGP13631 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RARGP13631 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RARGP13631 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RARGP13631 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARGP13631 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARGP13631 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RARGP13631 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARGP13631 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARGP13631 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARGP13631 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARGP13631 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARGP13631 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RARGP13631 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RARGP13631 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RARGP13631 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RARGP13631 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RARGP13631 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RARGP13631 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RARGP13631 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RARGP13631 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RARGP13631 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RARGP13631 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RARGP13631 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RARGP13631 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RARGP13631 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RARGP13631 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RARGP13631 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RARGP13631 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RARGP13631 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RARGP13631 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RARGP13631 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARGP13631 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARGP13631 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARGP13631 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARGP13631 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARGP13631 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARGP13631 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARGP13631 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARGP13631 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARGP13631 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARGP13631 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARGP13631 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARGP13631 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARGP13631 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARGP13631 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARGP13631 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARGP13631 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARGP13631 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARGP13631 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARGP13631 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARGP13631 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARGP13631 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RARGP13631 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARGP13631 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARGP13631 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARGP13631 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARGP13631 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARGP13631 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARGP13631 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARGP13631 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARGP13631 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARGP13631 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARGP13631 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARGP13631 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARGP13631 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARGP13631 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms