Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCL5P13501 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCL5P13501 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCL5P13501 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCL5P13501 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCL5P13501 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCL5P13501 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCL5P13501 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCL5P13501 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCL5P13501 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCL5P13501 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCL5P13501 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCL5P13501 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCL5P13501 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCL5P13501 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCL5P13501 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCL5P13501 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCL5P13501 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCL5P13501 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCL5P13501 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCL5P13501 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCL5P13501 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCL5P13501 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCL5P13501 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCL5P13501 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCL5P13501 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCL5P13501 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCL5P13501 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCL5P13501 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCL5P13501 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCL5P13501 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCL5P13501 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCL5P13501 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCL5P13501 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCL5P13501 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCL5P13501 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CCL5P13501 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCL5P13501 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCL5P13501 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCL5P13501 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCL5P13501 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCL5P13501 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCL5P13501 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCL5P13501 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCL5P13501 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCL5P13501 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCL5P13501 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCL5P13501 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCL5P13501 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCL5P13501 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCL5P13501 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCL5P13501 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCL5P13501 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CCL5P13501 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCL5P13501 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCL5P13501 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCL5P13501 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCL5P13501 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCL5P13501 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCL5P13501 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCL5P13501 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCL5P13501 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCL5P13501 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCL5P13501 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCL5P13501 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCL5P13501 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCL5P13501 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCL5P13501 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCL5P13501 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCL5P13501 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCL5P13501 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCL5P13501 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCL5P13501 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCL5P13501 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCL5P13501 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCL5P13501 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCL5P13501 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCL5P13501 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCL5P13501 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCL5P13501 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCL5P13501 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCL5P13501 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCL5P13501 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCL5P13501 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCL5P13501 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCL5P13501 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCL5P13501 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCL5P13501 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCL5P13501 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCL5P13501 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCL5P13501 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCL5P13501 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCL5P13501 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCL5P13501 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCL5P13501 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCL5P13501 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCL5P13501 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCL5P13501 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCL5P13501 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCL5P13501 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms