Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX5BP10606 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COX5BP10606 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COX5BP10606 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COX5BP10606 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COX5BP10606 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX5BP10606 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX5BP10606 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX5BP10606 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX5BP10606 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX5BP10606 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX5BP10606 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX5BP10606 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX5BP10606 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX5BP10606 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX5BP10606 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX5BP10606 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX5BP10606 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX5BP10606 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX5BP10606 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX5BP10606 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX5BP10606 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX5BP10606 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX5BP10606 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX5BP10606 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX5BP10606 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX5BP10606 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX5BP10606 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX5BP10606 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COX5BP10606 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COX5BP10606 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COX5BP10606 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COX5BP10606 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COX5BP10606 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COX5BP10606 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COX5BP10606 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COX5BP10606 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COX5BP10606 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX5BP10606 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX5BP10606 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX5BP10606 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX5BP10606 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX5BP10606 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX5BP10606 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX5BP10606 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX5BP10606 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX5BP10606 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX5BP10606 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX5BP10606 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COX5BP10606 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX5BP10606 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX5BP10606 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX5BP10606 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX5BP10606 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX5BP10606 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX5BP10606 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX5BP10606 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX5BP10606 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX5BP10606 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COX5BP10606 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COX5BP10606 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COX5BP10606 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COX5BP10606 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX5BP10606 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX5BP10606 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX5BP10606 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX5BP10606 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX5BP10606 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX5BP10606 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX5BP10606 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COX5BP10606 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COX5BP10606 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COX5BP10606 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COX5BP10606 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COX5BP10606 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COX5BP10606 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COX5BP10606 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COX5BP10606 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COX5BP10606 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COX5BP10606 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COX5BP10606 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COX5BP10606 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COX5BP10606 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COX5BP10606 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COX5BP10606 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COX5BP10606 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COX5BP10606 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COX5BP10606 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COX5BP10606 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
COX5BP10606 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX5BP10606 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX5BP10606 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COX5BP10606 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX5BP10606 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX5BP10606 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX5BP10606 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COX5BP10606 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX5BP10606 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COX5BP10606 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COX5BP10606 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms