Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TGFB3P10600 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TGFB3P10600 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TGFB3P10600 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TGFB3P10600 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TGFB3P10600 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TGFB3P10600 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TGFB3P10600 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms