Protein–RNA interactions for Protein: P0DP91

CSB-PGBD3, Chimeric ERCC6-PGBD3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSB-PGBD3P0DP91 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CSB-PGBD3P0DP91 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CSB-PGBD3P0DP91 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CSB-PGBD3P0DP91 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CSB-PGBD3P0DP91 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CSB-PGBD3P0DP91 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
CSB-PGBD3P0DP91 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CSB-PGBD3P0DP91 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CSB-PGBD3P0DP91 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CSB-PGBD3P0DP91 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CSB-PGBD3P0DP91 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CSB-PGBD3P0DP91 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CSB-PGBD3P0DP91 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CSB-PGBD3P0DP91 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CSB-PGBD3P0DP91 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CSB-PGBD3P0DP91 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CSB-PGBD3P0DP91 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CSB-PGBD3P0DP91 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CSB-PGBD3P0DP91 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CSB-PGBD3P0DP91 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CSB-PGBD3P0DP91 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CSB-PGBD3P0DP91 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CSB-PGBD3P0DP91 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CSB-PGBD3P0DP91 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CSB-PGBD3P0DP91 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CSB-PGBD3P0DP91 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CSB-PGBD3P0DP91 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CSB-PGBD3P0DP91 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CSB-PGBD3P0DP91 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CSB-PGBD3P0DP91 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CSB-PGBD3P0DP91 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CSB-PGBD3P0DP91 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CSB-PGBD3P0DP91 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CSB-PGBD3P0DP91 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CSB-PGBD3P0DP91 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CSB-PGBD3P0DP91 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CSB-PGBD3P0DP91 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CSB-PGBD3P0DP91 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CSB-PGBD3P0DP91 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CSB-PGBD3P0DP91 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CSB-PGBD3P0DP91 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CSB-PGBD3P0DP91 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CSB-PGBD3P0DP91 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CSB-PGBD3P0DP91 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CSB-PGBD3P0DP91 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CSB-PGBD3P0DP91 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CSB-PGBD3P0DP91 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CSB-PGBD3P0DP91 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CSB-PGBD3P0DP91 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CSB-PGBD3P0DP91 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CSB-PGBD3P0DP91 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CSB-PGBD3P0DP91 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
CSB-PGBD3P0DP91 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CSB-PGBD3P0DP91 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CSB-PGBD3P0DP91 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CSB-PGBD3P0DP91 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CSB-PGBD3P0DP91 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CSB-PGBD3P0DP91 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms