Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMIGD3P0DMS9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMIGD3P0DMS9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD3P0DMS9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms