Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAA2P0DJI9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAA2P0DJI9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAA2P0DJI9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAA2P0DJI9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms