Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRSS56P0CW18 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRSS56P0CW18 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRSS56P0CW18 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRSS56P0CW18 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRSS56P0CW18 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRSS56P0CW18 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRSS56P0CW18 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRSS56P0CW18 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRSS56P0CW18 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRSS56P0CW18 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRSS56P0CW18 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRSS56P0CW18 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRSS56P0CW18 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRSS56P0CW18 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRSS56P0CW18 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRSS56P0CW18 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRSS56P0CW18 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRSS56P0CW18 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms