Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRR29P0C7W0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRR29P0C7W0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRR29P0C7W0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRR29P0C7W0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRR29P0C7W0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRR29P0C7W0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRR29P0C7W0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRR29P0C7W0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRR29P0C7W0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRR29P0C7W0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRR29P0C7W0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRR29P0C7W0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRR29P0C7W0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRR29P0C7W0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRR29P0C7W0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRR29P0C7W0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRR29P0C7W0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRR29P0C7W0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRR29P0C7W0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRR29P0C7W0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRR29P0C7W0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRR29P0C7W0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRR29P0C7W0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRR29P0C7W0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRR29P0C7W0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRR29P0C7W0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRR29P0C7W0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRR29P0C7W0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRR29P0C7W0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms