Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPAP09012 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPAP09012 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRPAP09012 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRPAP09012 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRPAP09012 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRPAP09012 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRPAP09012 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRPAP09012 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRPAP09012 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRPAP09012 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRPAP09012 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRPAP09012 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRPAP09012 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRPAP09012 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRPAP09012 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPAP09012 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNRPAP09012 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPAP09012 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms