Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD63P08962 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD63P08962 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD63P08962 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD63P08962 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD63P08962 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD63P08962 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD63P08962 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD63P08962 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD63P08962 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD63P08962 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CD63P08962 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CD63P08962 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD63P08962 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD63P08962 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CD63P08962 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD63P08962 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD63P08962 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD63P08962 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD63P08962 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD63P08962 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD63P08962 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD63P08962 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD63P08962 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD63P08962 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD63P08962 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CD63P08962 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD63P08962 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD63P08962 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD63P08962 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD63P08962 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD63P08962 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD63P08962 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD63P08962 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD63P08962 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD63P08962 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD63P08962 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD63P08962 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD63P08962 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD63P08962 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD63P08962 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD63P08962 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD63P08962 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD63P08962 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD63P08962 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD63P08962 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD63P08962 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CD63P08962 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD63P08962 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD63P08962 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD63P08962 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD63P08962 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD63P08962 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD63P08962 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD63P08962 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD63P08962 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD63P08962 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD63P08962 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD63P08962 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD63P08962 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD63P08962 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD63P08962 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD63P08962 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD63P08962 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD63P08962 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD63P08962 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD63P08962 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD63P08962 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD63P08962 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD63P08962 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD63P08962 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD63P08962 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD63P08962 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD63P08962 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD63P08962 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD63P08962 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD63P08962 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD63P08962 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CD63P08962 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD63P08962 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD63P08962 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD63P08962 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD63P08962 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD63P08962 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CD63P08962 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CD63P08962 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD63P08962 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD63P08962 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD63P08962 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD63P08962 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD63P08962 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD63P08962 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD63P08962 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD63P08962 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD63P08962 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD63P08962 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD63P08962 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD63P08962 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD63P08962 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD63P08962 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms