Protein–RNA interactions for Protein: P08908

HTR1A, 5-hydroxytryptamine receptor 1A, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1AP08908 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR1AP08908 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR1AP08908 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR1AP08908 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR1AP08908 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR1AP08908 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTR1AP08908 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTR1AP08908 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTR1AP08908 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTR1AP08908 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTR1AP08908 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR1AP08908 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR1AP08908 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR1AP08908 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HTR1AP08908 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1AP08908 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR1AP08908 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR1AP08908 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms