Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LYNP07948 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LYNP07948 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LYNP07948 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LYNP07948 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LYNP07948 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LYNP07948 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LYNP07948 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LYNP07948 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LYNP07948 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LYNP07948 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LYNP07948 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYNP07948 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYNP07948 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYNP07948 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LYNP07948 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LYNP07948 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LYNP07948 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LYNP07948 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LYNP07948 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYNP07948 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYNP07948 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYNP07948 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYNP07948 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYNP07948 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYNP07948 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYNP07948 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYNP07948 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LYNP07948 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LYNP07948 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LYNP07948 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LYNP07948 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LYNP07948 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYNP07948 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYNP07948 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYNP07948 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYNP07948 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYNP07948 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LYNP07948 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LYNP07948 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LYNP07948 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LYNP07948 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYNP07948 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYNP07948 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYNP07948 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYNP07948 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYNP07948 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYNP07948 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYNP07948 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYNP07948 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYNP07948 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYNP07948 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYNP07948 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYNP07948 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYNP07948 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LYNP07948 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYNP07948 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYNP07948 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYNP07948 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYNP07948 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYNP07948 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYNP07948 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LYNP07948 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LYNP07948 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LYNP07948 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LYNP07948 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LYNP07948 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LYNP07948 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYNP07948 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYNP07948 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYNP07948 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYNP07948 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYNP07948 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYNP07948 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYNP07948 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYNP07948 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYNP07948 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYNP07948 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYNP07948 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYNP07948 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYNP07948 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYNP07948 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LYNP07948 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYNP07948 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LYNP07948 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LYNP07948 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYNP07948 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYNP07948 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYNP07948 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYNP07948 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYNP07948 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYNP07948 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYNP07948 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYNP07948 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYNP07948 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYNP07948 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LYNP07948 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYNP07948 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYNP07948 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LYNP07948 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.3 ms