Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
KLK3P07288 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLK3P07288 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLK3P07288 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLK3P07288 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLK3P07288 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLK3P07288 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLK3P07288 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLK3P07288 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLK3P07288 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLK3P07288 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLK3P07288 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLK3P07288 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLK3P07288 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLK3P07288 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KLK3P07288 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLK3P07288 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KLK3P07288 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLK3P07288 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLK3P07288 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLK3P07288 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLK3P07288 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLK3P07288 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLK3P07288 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLK3P07288 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLK3P07288 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLK3P07288 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KLK3P07288 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLK3P07288 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLK3P07288 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLK3P07288 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLK3P07288 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLK3P07288 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLK3P07288 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLK3P07288 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLK3P07288 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLK3P07288 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLK3P07288 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLK3P07288 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLK3P07288 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLK3P07288 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLK3P07288 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLK3P07288 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLK3P07288 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLK3P07288 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLK3P07288 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KLK3P07288 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLK3P07288 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLK3P07288 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLK3P07288 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLK3P07288 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLK3P07288 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLK3P07288 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLK3P07288 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLK3P07288 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLK3P07288 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLK3P07288 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLK3P07288 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLK3P07288 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLK3P07288 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLK3P07288 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLK3P07288 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLK3P07288 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLK3P07288 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLK3P07288 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLK3P07288 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLK3P07288 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLK3P07288 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLK3P07288 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLK3P07288 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLK3P07288 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLK3P07288 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLK3P07288 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLK3P07288 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLK3P07288 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLK3P07288 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLK3P07288 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLK3P07288 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLK3P07288 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLK3P07288 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLK3P07288 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLK3P07288 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLK3P07288 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KLK3P07288 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLK3P07288 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLK3P07288 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLK3P07288 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLK3P07288 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLK3P07288 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLK3P07288 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLK3P07288 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLK3P07288 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLK3P07288 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLK3P07288 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLK3P07288 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLK3P07288 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLK3P07288 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLK3P07288 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLK3P07288 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLK3P07288 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.7 ms