Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB1P05556 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGB1P05556 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGB1P05556 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ITGB1P05556 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB1P05556 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB1P05556 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB1P05556 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB1P05556 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB1P05556 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB1P05556 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB1P05556 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB1P05556 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB1P05556 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB1P05556 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB1P05556 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB1P05556 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB1P05556 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB1P05556 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB1P05556 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB1P05556 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB1P05556 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB1P05556 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB1P05556 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms