Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
F13BP05160 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
F13BP05160 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
F13BP05160 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
F13BP05160 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F13BP05160 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F13BP05160 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
F13BP05160 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F13BP05160 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
F13BP05160 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
F13BP05160 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
F13BP05160 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
F13BP05160 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
F13BP05160 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
F13BP05160 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
F13BP05160 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
F13BP05160 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
F13BP05160 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
F13BP05160 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
F13BP05160 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
F13BP05160 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
F13BP05160 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
F13BP05160 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
F13BP05160 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
F13BP05160 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
F13BP05160 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
F13BP05160 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
F13BP05160 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
F13BP05160 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
F13BP05160 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
F13BP05160 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
F13BP05160 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
F13BP05160 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
F13BP05160 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
F13BP05160 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
F13BP05160 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
F13BP05160 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
F13BP05160 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
F13BP05160 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
F13BP05160 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
F13BP05160 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
F13BP05160 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
F13BP05160 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
F13BP05160 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
F13BP05160 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
F13BP05160 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
F13BP05160 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
F13BP05160 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
F13BP05160 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
F13BP05160 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F13BP05160 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F13BP05160 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F13BP05160 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
F13BP05160 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
F13BP05160 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
F13BP05160 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
F13BP05160 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F13BP05160 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
F13BP05160 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F13BP05160 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
F13BP05160 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
F13BP05160 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F13BP05160 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
F13BP05160 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
F13BP05160 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
F13BP05160 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F13BP05160 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F13BP05160 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F13BP05160 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F13BP05160 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F13BP05160 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F13BP05160 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F13BP05160 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F13BP05160 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F13BP05160 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F13BP05160 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F13BP05160 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F13BP05160 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F13BP05160 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F13BP05160 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F13BP05160 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
F13BP05160 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
F13BP05160 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
F13BP05160 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F13BP05160 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
F13BP05160 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
F13BP05160 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
F13BP05160 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
F13BP05160 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
F13BP05160 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
F13BP05160 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
F13BP05160 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
F13BP05160 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F13BP05160 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
F13BP05160 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F13BP05160 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F13BP05160 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
F13BP05160 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F13BP05160 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F13BP05160 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms