Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF2P04141 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF2P04141 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSF2P04141 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF2P04141 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF2P04141 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF2P04141 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF2P04141 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF2P04141 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF2P04141 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF2P04141 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF2P04141 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF2P04141 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF2P04141 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF2P04141 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF2P04141 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF2P04141 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF2P04141 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF2P04141 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF2P04141 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF2P04141 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF2P04141 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF2P04141 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF2P04141 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF2P04141 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF2P04141 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF2P04141 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF2P04141 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF2P04141 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF2P04141 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF2P04141 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF2P04141 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF2P04141 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF2P04141 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF2P04141 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF2P04141 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF2P04141 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF2P04141 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF2P04141 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF2P04141 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF2P04141 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF2P04141 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF2P04141 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF2P04141 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF2P04141 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF2P04141 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF2P04141 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF2P04141 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF2P04141 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF2P04141 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF2P04141 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF2P04141 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF2P04141 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF2P04141 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF2P04141 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF2P04141 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF2P04141 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF2P04141 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF2P04141 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CSF2P04141 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF2P04141 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF2P04141 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF2P04141 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF2P04141 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF2P04141 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF2P04141 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF2P04141 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF2P04141 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF2P04141 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF2P04141 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF2P04141 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF2P04141 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF2P04141 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF2P04141 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF2P04141 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF2P04141 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSF2P04141 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSF2P04141 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSF2P04141 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSF2P04141 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSF2P04141 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSF2P04141 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSF2P04141 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSF2P04141 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSF2P04141 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSF2P04141 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSF2P04141 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSF2P04141 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSF2P04141 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSF2P04141 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSF2P04141 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSF2P04141 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSF2P04141 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSF2P04141 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSF2P04141 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CSF2P04141 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSF2P04141 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSF2P04141 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSF2P04141 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSF2P04141 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms