Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ESR1P03372 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ESR1P03372 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ESR1P03372 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ESR1P03372 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ESR1P03372 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ESR1P03372 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ESR1P03372 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ESR1P03372 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ESR1P03372 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ESR1P03372 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ESR1P03372 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ESR1P03372 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ESR1P03372 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ESR1P03372 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ESR1P03372 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ESR1P03372 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ESR1P03372 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ESR1P03372 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ESR1P03372 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ESR1P03372 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ESR1P03372 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ESR1P03372 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ESR1P03372 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ESR1P03372 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ESR1P03372 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ESR1P03372 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ESR1P03372 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ESR1P03372 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ESR1P03372 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ESR1P03372 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ESR1P03372 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ESR1P03372 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ESR1P03372 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ESR1P03372 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ESR1P03372 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ESR1P03372 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ESR1P03372 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ESR1P03372 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ESR1P03372 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ESR1P03372 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ESR1P03372 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ESR1P03372 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ESR1P03372 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ESR1P03372 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ESR1P03372 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ESR1P03372 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ESR1P03372 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ESR1P03372 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ESR1P03372 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ESR1P03372 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ESR1P03372 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ESR1P03372 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ESR1P03372 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ESR1P03372 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ESR1P03372 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ESR1P03372 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ESR1P03372 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ESR1P03372 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ESR1P03372 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ESR1P03372 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ESR1P03372 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ESR1P03372 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ESR1P03372 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ESR1P03372 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ESR1P03372 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ESR1P03372 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ESR1P03372 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ESR1P03372 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ESR1P03372 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ESR1P03372 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ESR1P03372 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ESR1P03372 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ESR1P03372 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ESR1P03372 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ESR1P03372 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ESR1P03372 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ESR1P03372 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ESR1P03372 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ESR1P03372 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ESR1P03372 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ESR1P03372 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ESR1P03372 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ESR1P03372 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ESR1P03372 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ESR1P03372 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ESR1P03372 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ESR1P03372 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ESR1P03372 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ESR1P03372 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ESR1P03372 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ESR1P03372 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ESR1P03372 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ESR1P03372 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ESR1P03372 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ESR1P03372 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ESR1P03372 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ESR1P03372 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ESR1P03372 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ESR1P03372 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms