Protein–RNA interactions for Protein: P02778

CXCL10, C-X-C motif chemokine 10, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL10P02778 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CXCL10P02778 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CXCL10P02778 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL10P02778 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL10P02778 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL10P02778 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL10P02778 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CXCL10P02778 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXCL10P02778 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CXCL10P02778 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CXCL10P02778 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CXCL10P02778 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CXCL10P02778 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CXCL10P02778 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CXCL10P02778 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CXCL10P02778 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CXCL10P02778 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CXCL10P02778 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CXCL10P02778 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CXCL10P02778 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CXCL10P02778 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CXCL10P02778 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CXCL10P02778 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CXCL10P02778 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CXCL10P02778 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CXCL10P02778 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CXCL10P02778 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CXCL10P02778 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CXCL10P02778 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CXCL10P02778 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CXCL10P02778 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CXCL10P02778 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CXCL10P02778 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CXCL10P02778 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CXCL10P02778 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CXCL10P02778 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CXCL10P02778 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CXCL10P02778 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CXCL10P02778 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CXCL10P02778 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CXCL10P02778 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CXCL10P02778 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CXCL10P02778 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CXCL10P02778 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CXCL10P02778 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CXCL10P02778 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CXCL10P02778 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CXCL10P02778 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CXCL10P02778 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CXCL10P02778 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CXCL10P02778 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms