Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC1P02654 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC1P02654 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC1P02654 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC1P02654 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOC1P02654 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOC1P02654 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOC1P02654 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOC1P02654 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOC1P02654 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC1P02654 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC1P02654 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOC1P02654 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC1P02654 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOC1P02654 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC1P02654 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC1P02654 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC1P02654 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOC1P02654 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOC1P02654 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOC1P02654 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOC1P02654 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOC1P02654 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOC1P02654 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOC1P02654 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOC1P02654 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOC1P02654 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOC1P02654 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOC1P02654 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOC1P02654 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOC1P02654 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOC1P02654 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOC1P02654 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOC1P02654 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOC1P02654 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC1P02654 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC1P02654 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOC1P02654 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOC1P02654 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOC1P02654 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOC1P02654 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOC1P02654 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOC1P02654 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC1P02654 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC1P02654 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC1P02654 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC1P02654 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC1P02654 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC1P02654 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC1P02654 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOC1P02654 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC1P02654 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC1P02654 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC1P02654 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC1P02654 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOC1P02654 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC1P02654 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC1P02654 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC1P02654 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC1P02654 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC1P02654 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC1P02654 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC1P02654 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC1P02654 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC1P02654 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC1P02654 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOC1P02654 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOC1P02654 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOC1P02654 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOC1P02654 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC1P02654 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC1P02654 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC1P02654 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOC1P02654 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC1P02654 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC1P02654 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC1P02654 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC1P02654 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOC1P02654 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC1P02654 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC1P02654 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC1P02654 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC1P02654 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC1P02654 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOC1P02654 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC1P02654 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC1P02654 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOC1P02654 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC1P02654 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC1P02654 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC1P02654 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC1P02654 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC1P02654 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOC1P02654 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOC1P02654 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC1P02654 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC1P02654 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC1P02654 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC1P02654 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APOC1P02654 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms