Protein–RNA interactions for Protein: P01350

GAST, Gastrin, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GASTP01350 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GASTP01350 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GASTP01350 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GASTP01350 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GASTP01350 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GASTP01350 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GASTP01350 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GASTP01350 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GASTP01350 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GASTP01350 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GASTP01350 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GASTP01350 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GASTP01350 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GASTP01350 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GASTP01350 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GASTP01350 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GASTP01350 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GASTP01350 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GASTP01350 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GASTP01350 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GASTP01350 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GASTP01350 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GASTP01350 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GASTP01350 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GASTP01350 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GASTP01350 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GASTP01350 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GASTP01350 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GASTP01350 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GASTP01350 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GASTP01350 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GASTP01350 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GASTP01350 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GASTP01350 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GASTP01350 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GASTP01350 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GASTP01350 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GASTP01350 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GASTP01350 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GASTP01350 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GASTP01350 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GASTP01350 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GASTP01350 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GASTP01350 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GASTP01350 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GASTP01350 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GASTP01350 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GASTP01350 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GASTP01350 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GASTP01350 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GASTP01350 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GASTP01350 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GASTP01350 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GASTP01350 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GASTP01350 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GASTP01350 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GASTP01350 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GASTP01350 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GASTP01350 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GASTP01350 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GASTP01350 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GASTP01350 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GASTP01350 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GASTP01350 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GASTP01350 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GASTP01350 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GASTP01350 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GASTP01350 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GASTP01350 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GASTP01350 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GASTP01350 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GASTP01350 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GASTP01350 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GASTP01350 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GASTP01350 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GASTP01350 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GASTP01350 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GASTP01350 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GASTP01350 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GASTP01350 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GASTP01350 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GASTP01350 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GASTP01350 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GASTP01350 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GASTP01350 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GASTP01350 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GASTP01350 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GASTP01350 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GASTP01350 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GASTP01350 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GASTP01350 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GASTP01350 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GASTP01350 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GASTP01350 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GASTP01350 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GASTP01350 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GASTP01350 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GASTP01350 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GASTP01350 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GASTP01350 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms