Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SERPINC1P01008 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SERPINC1P01008 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SERPINC1P01008 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SERPINC1P01008 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SERPINC1P01008 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SERPINC1P01008 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SERPINC1P01008 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SERPINC1P01008 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SERPINC1P01008 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SERPINC1P01008 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SERPINC1P01008 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SERPINC1P01008 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SERPINC1P01008 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SERPINC1P01008 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SERPINC1P01008 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SERPINC1P01008 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SERPINC1P01008 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SERPINC1P01008 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SERPINC1P01008 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SERPINC1P01008 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SERPINC1P01008 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SERPINC1P01008 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SERPINC1P01008 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SERPINC1P01008 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SERPINC1P01008 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SERPINC1P01008 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SERPINC1P01008 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SERPINC1P01008 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SERPINC1P01008 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SERPINC1P01008 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SERPINC1P01008 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SERPINC1P01008 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms